Международное сотрудничество занимает важное место в деятельности НКЦ и направлено на решение конкретных задач, призванных содействовать развитию клиринговых сервисов и риск-менеджмента  с учетом лучших мировых  практиками и в соответствии с международными стандартами.

НКЦ сотрудничает  с центральными контрагентами, с другими институтами  инфраструктуры финансового рынка  Европы и различных стран мира  на двусторонней основе и в формате  участия в качестве полноправного члена в профессиональных международных  организациях - Всемирной Ассоциации центральных контрагентов – CCP12 (Global Association of Central Counterparties–CCP12) и Европейской Ассоциации клиринговых домов – центральных контрагентов (European Association of Central Counterparty Clearing Houses–EACH).

   Членство  в CCP12 и EACH  позволяет НКЦ активно участвовать в профессиональных дискуссиях, в выработке позиций ассоциаций по актуальным проблемам регулирования ЦК, гармонизации законодательства и стандартов их деятельности. Одновременно это позволяет распространять на российский финансовый рынок мировой опыт в сфере клирингового обслуживания, управления рисками и повышения эффективности биржевой торговли.